百度开源肿瘤识别AI算法 准确率超专业病理医生
笔墨哥 发布于2018-06 浏览:35566 回复:311
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近日,百度研究院发表论文提出一种名为“神经条件随机场”的全新病理切片分析算法,将肿瘤识别定位准确率大幅提高。在公开数据集 Camelyon 16大赛测试集上,该算法的肿瘤定位 FROC 分数达到0.8096,超过专业病理医生水平以及由哈佛和麻省理工学院联合团队所保持的最好成绩。

除了病理学切片分析方面的研究,百度还在积极探索 AI 在眼底影像、放射影像、以及智能问诊等其他一些医疗领域的应用。

一直以来,病理切片分析都是癌症诊断中的黄金标准。但是即便对于经验丰富的病理医生来说,病理切片的阅片流程也十分困难复杂。一张40倍放大的电子化病理切片通常由超过十亿个像素点组成,磁盘空间大小超过1GB。

然而淋巴结附近微转移肿瘤细胞群可能最小只有不到1000像素的直径。而一旦发现微转移肿瘤细胞群,病人的治疗方案和预后可能就会有极大差别。因此,详尽的阅读病理切片,且不漏掉任何一处具有临床价值的病灶,如同大海捞针,是一项十分复杂和耗时的任务(如图一所示)。

为了帮助病理医生更有效地阅读病理切片,研究人员提出了许多深度学习算法,来预测病理切片中的肿瘤细胞区域。由于原始病理切片的图片尺寸十分庞大,绝大部分深度学习算法只能将每张病理切片剪切成大量尺寸小些的图块,比如256x256像素。这样经典的深度卷积网络就可以被用来训练及预测每张图块是否是肿瘤区域。

然而在不知道图块周边区域的情况下,仅凭单张图块,有时候很难预测其是否为肿瘤区域,尤其是在肿瘤与正常组织交界部位。由此产生的假阳性也十分显著。


当病理医生碰到这种困难的情况时,通常会缩小当前感兴趣的图块,以观测周边区域,作出更准确的判断。类似的,百度研究院提出一种全新的深度学习算法,一次性输入一组3x3的图块,并联合预测每一张图块是否有肿瘤区域。图块之间的空间关系可以通过一种名为“条件随机场”的概率图模型来模拟。整套算法框架可以在 GPU 上进行端到端的训练,而不需任何后处理的步骤(如图所示)。


由于考虑到了相邻图块之间的空间关系,该算法让假阳性得以大大降低,算法预测的肿瘤区域也更加平滑(如图四所示)。对比之前的算法,这种算法除了真实肿瘤区域外,几乎没有引入任何其他假阳性区域。


图四. (a) 原始病理切片; (b) 病理医生标注,其中白色部分为肿瘤区域; (c) 以前算法预测的肿瘤区域; (d) 百度研究院“神经条件随机场”算法预测的肿瘤区域。

在 Camelyon 16大赛的测试集上,“神经条件随机场”算法获得了高达0.8096的肿瘤定位 FROC 分数,不仅显著超越了专业的病理医生水平(0.7240),也超过了之前大赛的最好成绩(0.8074)。同时,百度研究院也在 Github 上开源了整套算法代码,以便其他研究人员在此基础上进行更深入的研究,促进人工智能在医学图像分析领域取得更加长足的发展。

在提高病理切片检测的效率、准确性上,这种新的肿瘤检测算法拥有很大潜力。它让病理学家能更聚焦由算法突出的肿瘤区域,而不必搜索整个切片。当然,对算法的全面评估,也需要更大的数据集来做进一步临床研究。

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共311条回复 最后由用户已被禁言回复于2022-04
#92蓝色的风339回复于2018-11
#90 笔墨哥回复
很简单,刷脸排号,然后根据工作人员的要求睁眼闭眼,然后刷脸取结果。速度快...片子拍的也蛮清晰的
展开

这样子真的是很方便

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#91秘密花园jay回复于2018-11
#85 笔墨哥回复
ai出结果相当快....不过手术前,大夫肯定还是要看报告的

以后让ai分析细胞或者病毒的发展情况,给病人更及时准确的提醒

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#90笔墨哥回复于2018-11
#89 蓝兰兰111回复
ai结果的专业性怎么样,你亲身体验感觉怎么样

很简单,刷脸排号,然后根据工作人员的要求睁眼闭眼,然后刷脸取结果。速度快...片子拍的也蛮清晰的

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#89蓝兰兰111回复于2018-11
#85 笔墨哥回复
ai出结果相当快....不过手术前,大夫肯定还是要看报告的

ai结果的专业性怎么样,你亲身体验感觉怎么样

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#88蓝色的风339回复于2018-11

估计以后说不定能靠AI直接治病了

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#87蓝色的风339回复于2018-11
#85 笔墨哥回复
ai出结果相当快....不过手术前,大夫肯定还是要看报告的

现在还不能让AI来直接下诊断

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#86蓝色的风339回复于2018-11

有了AI辅助应该会大大的减少误诊

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#85笔墨哥回复于2018-11
#84 worddict回复
我觉得还是要AI+医生更稳妥

ai出结果相当快....不过手术前,大夫肯定还是要看报告的

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#84worddict回复于2018-11
#81 蓝兰兰111回复
用AI检测准确性会更高一些,判断结果更准确一些  

我觉得还是要AI+医生更稳妥

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#83worddict回复于2018-11
#82 jyblbq1314回复
是通过AI的什么功能或者推广吗,是AI的什么应用?

他说的应该是在医学方面的应用吧

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#82jyblbq1314回复于2018-10
#77 求代课1357回复
前天又跟医生朋友探讨了下,了解更加深入啦

是通过AI的什么功能或者推广吗,是AI的什么应用?

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#81蓝兰兰111回复于2018-10
#78 风搅火回复
让检测更方便,让人们看病更方便

用AI检测准确性会更高一些,判断结果更准确一些

 

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#80蓝兰兰111回复于2018-10
#77 求代课1357回复
前天又跟医生朋友探讨了下,了解更加深入啦

是了解的什么方面呢?可以给分享一下

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#79风搅火回复于2018-10
#70 worddict回复
现在部分应用AI已经可以赶得上人了

最关键的还是治疗上的研究

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#78风搅火回复于2018-10
#75 worddict回复
所以现在大部分还是AI辅助人类

让检测更方便,让人们看病更方便

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#77求代课1357回复于2018-10

前天又跟医生朋友探讨了下,了解更加深入啦

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#76worddict回复于2018-10
#74 秘密花园jay回复
恩 尤其是关于检测呀,检验呀等类似工作性质的

是的,现在不少这方面工作都可以用AI来识别了

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#75worddict回复于2018-10
#73 jyblbq1314回复
是,部分AI是可以做到,但是好多人还不太了解AI,要让AI更接近人民,才可能走的更远。
展开

所以现在大部分还是AI辅助人类

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#74秘密花园jay回复于2018-10
#70 worddict回复
现在部分应用AI已经可以赶得上人了

恩 尤其是关于检测呀,检验呀等类似工作性质的

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#73jyblbq1314回复于2018-10
#70 worddict回复
现在部分应用AI已经可以赶得上人了

是,部分AI是可以做到,但是好多人还不太了解AI,要让AI更接近人民,才可能走的更远。

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